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2023年2月1日水曜日

【統計ソフト】MacでEZRを使用する際のTIPS(5)：文字のずれを解消する(一時的)

Mac環境でEZRを使用する際の困りごとの解消方法を説明するシリーズです。(ラベル＝EZRMacTIPS)  

文字のズレを解消する(一時的)　作業難易度★(やさしい)

Mac版EZRで，インポートしたデータを表示したり分析の結果を表示する際に，行によって横幅が揃わずガタガタになっていることがあります。フォントを変更することで，このガタガタを軽減～解消することができます。
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【統計ソフト】MacでEZRを使用する際のTIPS(4)：Rを起動したらEZRが自動起動するようにする

Mac環境でEZRを使用する際の困りごとの解消方法を説明するシリーズです。(ラベル＝EZRMacTIPS) 

Rを起動したらEZRが自動起動するようにする　作業難易度★★(ちょいむず)

MacでEZRを使用するには，起動時にコマンド(library(Rcmdr))を入力したり，プラグイン起動やRの再起動を行わなければならず，少々手間がかかります。このひと手間を解消する方法を紹介します。

Rが起動時に参照する設定ファイル「.Rprofile」に以下のコマンドを入力しておくことで，Rを起動するだけで自動的にEZRまで起動します。

options(Rcmdr=list(plugins='RcmdrPlugin.EZR'))
library(Rcmdr)
local({
old <- getOption('defaultPackages')
options(defaultPackages = c(old, 'Rcmdr'))
})
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【統計ソフト】MacでEZRを使用する際のTIPS(3)：グラフの日本語文字化け対策

Mac環境でEZRを使用する際の困りごとの解消方法を説明するシリーズです。(ラベル＝EZRMacTIPS)

グラフの日本語文字化け対策　作業難易度★★(ちょいむず)

Mac版EZRでグラフを作成すると，日本語の文字列が豆腐状(□□□)に文字化けしてしまいます。これを修正します。

Rコマンダーの「Rスクリプト」欄に以下のコマンドを記入することで，グラフ出力時の文字化けを防ぐことができます。

par(family = "HiraKakuProN-W3")
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【統計ソフト】MacでEZRを使用する際のTIPS(2)：グラフを画像としてコピーする

Mac環境でEZRを使用する際の困りごとの解消方法を説明するシリーズです。(ラベル＝EZRMacTIPS)

グラフを画像としてコピーする　作業難易度★(やさしい)

Mac版EZRでグラフを「保存」すると，標準ではPDFになってしまいます。

グラフを画像データとして利用したいときは，グラフウィンドウを選択した状態で「Command+C」を押してください。画像としてコピーされます。

その後，WordやPowerPoint上で「Command+V」を押すと，先程のグラフが貼り付けられます。背景は透過処理されています。

もしくはMacの標準機能で，「Shift+Command+5」でグラフウィンドをスクリーンショットで切り取っていただくという方法もあります。

【統計ソフトヘルプデスク】

HP：https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/mnc_stat.php
メール：mnc_stat☆ml.toho-u.jp
　※「☆」記号を「@」に置き換えて下さい。

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2022年8月26日金曜日

【統計ソフト】SPSSで作成したグラフや表を編集する方法

SPSSで作成したグラフや表を編集する方法を説明します。

※生存分析(Kaplan-Meier曲線)を例にして説明していますが，他の図表でも編集方法は同様です。

1. グラフの編集方法


1)編集するグラフをダブルクリックします

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2022年7月13日水曜日

【統計ソフト】MacでEZRを使用する際のTIPS(1)：メニューなどが英語で表示される場合の対処方法

Mac環境でEZRを使用する際の困りごとの解消方法を説明するシリーズです。(ラベル＝EZRMacTIPS)

Mac環境の「EZR」でメニューなどが英語(などの予期せぬ言語)で表示されている状況で，表示を日本語に変更する方法について説明します。

こんな風に英語メニューになっているのを直します。 

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2021年11月9日火曜日

【統計ソフト】フリー統計ソフト「EZR」に解析パッケージを追加して使用する方法

フリー統計ソフト「EZR」には統計解析のための基本的なRパッケージが含まれていますが，ここでは初期インストールに含まれていない解析パッケージの追加方法とその使用方法を説明します。なお，追加したパッケージはEZRのメニュー画面からは操作できないため，解析処理はR Consoleからコマンド操作によって行うことになります。

説明環境はWindows10, EZRのバージョンは1.53です。その他，説明内の情報は全て本記事作成時点のものです。

以下ではirrパッケージ(irr=inter-rater reliability:検者間信頼性)の追加と，irrパッケージによる級内相関係数(ICC)算出の方法を例に説明します。

Ⅰ. 追加方法

1. DLサイトの選択

R Console > メニューの「パッケージ」>「CRANミラーサイトの設定」
>「Japan(Tokyo)」を選んで「OK」。

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2021年6月16日水曜日

【統計ソフト】フリー統計ソフト「EZR」のMac環境でのインストール方法および起動方法

フリー統計ソフト「EZR」のMac環境でのインストール方法および起動方法について説明します。
 
説明環境はmacOS11.4(Big Sur), EZRのバージョンは1.54です。
その他，説明内のソフトのバージョンなどは全て本記事作成時点のものです。
EZRは，Intel(Core i...) MacでもApple Silicon(M...) Macでもどちらでも動作します。
 
Windows環境でのインストール・起動方法はこちらの記事をご参照下さい。 
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Mac環境では，EZR実行のために「XQuartz」というソフトを追加で使用します。 
また，EZRを直接起動するのではなく，Rを起動し，R上からパッケージのプラグインの一つとしてEZRを呼び出します。
 

I.インストール


1.「XQuartz」のインストール
 ・XQuartz
　まず，上記サイトから「XQuartz-2.8.1.dmg」をダウンロード後，インストールしてください。
 
 
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2021年5月25日火曜日

【統計ソフト】SPSSの簡易マニュアルを公開しました

 SPSSの簡易マニュアル「SPSSの基本的な操作メニュー案内」を公開しました。

SPSSの基本的な操作メニュー案内

SPSSを開くと見慣れぬ名前のメニューが多く，「どこから手を付けていいかわからない！！」となるかと思います。

このマニュアルでは，よく行う処理をメニューのどこから実行するのかを抜粋して紹介しています。

操作方法の詳細については，このマニュアルには記していません。操作方法の詳細が知りたい方は以下の本ヘルプデスク作成の動画シリーズをご利用ください。またはヘルプデスクまでご連絡ください。

・SPSSの基本(Youtubeへ移動)

【統計ソフトヘルプデスク】
メール：mnc_stat☆ml.toho-u.jp
　※「☆」記号を「@」に置き換えて下さい。
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2021年5月20日木曜日

【統計ソフト】SPSSの基本マニュアルを公開しました

SPSSの基本的な操作方法を実際の画面に沿って説明するマニュアルを公開しました。

SPSSを立ち上げたらまずすることから順番に，SPSSの操作方法の基礎の基礎を説明しています。

このほかの操作方法の詳細が知りたい方は以下の本ヘルプデスク作成の動画シリーズをご利用ください。またはヘルプデスクまでご連絡ください。

・SPSSの基本(Youtubeへ移動)

【統計ソフトヘルプデスク】
メール：mnc_stat☆ml.toho-u.jp
　※「☆」記号を「@」に置き換えて下さい。
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【統計ソフト】EZRの簡易マニュアルを公開しました

EZRの簡易マニュアル「EZRの基本事項及び操作メニュー案内」を公開しました。

EZRを開くと見慣れぬウィンドゥが立ち上がり，「どこから手を付けていいかわからない！！」となるかと思います。

このマニュアルでは，よく行う処理をメニューのどこから実行すればよいかを抜粋して紹介しています。

操作方法の詳細については，このマニュアルには記していませんので，ヘルプデスクまでご連絡ください。なお，操作方法の詳細を説明する動画を現在作成中です。SPSSについては以下から操作説明動画ご利用いただけます。

・SPSSの基本(Youtubeへ移動)

【統計ソフトヘルプデスク】
メール：mnc_stat☆ml.toho-u.jp
　※「☆」記号を「@」に置き換えて下さい。
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2020年10月26日月曜日

【統計ソフト】フリー統計ソフト「EZR」のWindows環境でのインストール方法および起動方法

フリー統計ソフト「EZR」のWindows環境でのインストール方法および起動方法について説明します。

説明環境はWindows10, EZRのバージョンは1.53です。
EZRの基本的な説明はこちらのブログ記事をご参照ください。

Mac環境でのインストール・起動方法はこちらの記事をご参照下さい。

1.ソフトの入手


1)以下のサイトにアクセスします。

・無料統計ソフトEZR (Easy R) - 自治医科大学
もしくは，Googleなどで「EZR」と検索すると上位に出てきます。

2)左側のメニューバーから「ダウンロード(Windows標準)」を選択します。


3)「Windows版はここをクリックしてダウンロードしてください(Ver. 1.53 2020/10/15)。」をクリックし，ダウンロードします。

バージョン名や更新日付などはダウンロードの時期によって異なる可能性があります。
サイズが600MBほどあります。インターネットの回線の状況によっては，ダウンロードに少々時間がかかります。

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2020年10月1日木曜日

【統計ソフト】SPSSとEZRの説明動画で使用しているSAMPLEファイルのダウンロードリンクと内容説明

SPSSとEZRの説明動画で使用しているSAMPLE(サンプル)ファイルのダウンロードリンク集です。また，ファイルの内容についても説明しています。

1.「sample_SHHS*」ファイルについて


イギリスで行われた心疾患有病率についての疫学研究(Scottish Heart Health Study(SHHS)1984-1986)を参考にしたSAMPLEデータです。

ファイルへのリンク
https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/doc/mmc/helpdesk/sample_SHHS.sav
https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/doc/mmc/helpdesk/sample_SHHS_v3.sav
https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/doc/mmc/helpdesk/sample_SHHS_v3.xlsx

データ数
・400行

カラム情報
【全ファイル共通】
・age：年齢
・age_range：年齢幅(1=40～44, 2=45～49, 3=50～54, 4=55～59)
・TC：総コレステロール(mmol/L)
・BMI：(kg/m2)
・SBP：収縮期血圧(mmHg)
・smoke：喫煙歴(1=never, 2=ex, 3=current)
・PA：身体活動(1=active, 2=average, 3=inactive)
・CHD：冠動脈疾患発生有無(0=no, 1=yes)

【sample_SHHS_v2】
・PA2値：身体活動有無(0=活動有, 1=活動無)
　※このカラムを追加しました。

【sample_SHHS_v3】
・PA2値v3：身体活動有無(0=活動無, 1=活動有)
　※v2と0/1の意味を逆にしました。
・smoke2値：喫煙有無(0=喫煙無，1=喫煙有)
　※このカラムを追加しました。
・SBP10：収縮期血圧(mmHg)/10
　※このカラムを追加しました。

2.「correlation」ファイルについて


6歳から18歳の架空の100人の子どもの，「身長」「体重」「BMI」「年齢」「あるテストの点数」のデータが含まれているSAMPLEデータです。

ファイルへのリンク

カラム情報
・身長：cm
・体重：kg
・BMI：体重/(身長(m))^2
・年齢：6～18
・点数：架空のテストの点数です。

3.「sample_recurrent」ファイルについて


架空の患者群の，ある疾患の再発までの日数などを記録したSAMPLEデータです。
なんらかの事情で再発無しのまま研究期間の途中で研究参加をやめた患者データについては，その時点までの日数を記録し，再発無としています。

ファイルへのリンク

データ数
・80行

カラム情報
・no.：ID
・sex：性別(F=女性，M=男性)
・treatment：治療法(0=A, 1=B)
・event：再発有無(0=再発なし，1=再発)
・recurrent_day：再発までの日数

4.「sample_enquete」ファイルについて


ある病院の看護師さんへの架空のアンケート結果を記録したSAMPLEデータです。
アンケートの質問項目は以下です。

問1　勤続年数を教えてください(年)
問2　性別を教えてください(0=男性, 1=女性）
問3　看護職としての業務について満足していますか
　　（1=不満, 2=少し不満, 3=普通, 4=少し満足, 5=満足）
問4　あなたが働く目的について，以下から選択してください【複数回答可】
　　（1=自己実現のため, 2=人の役に立ちたい, 3=収入を得るため, 4=その他（　　））

ファイルへのリンク

データ数
・30行

カラム情報
・ID：No.
・問1.勤続年数：年
・問2.性別：0=男性, 1=女性
・問3.満足度：1=不満, 2=少し不満, 3=普通, 4=少し満足, 5=満足
・問4.目的：自己実現のため(0/1)
・問4.目的：人の役に立ちたい(0/1)
・問4.目的：収入を得るため(0/1)
・問4.目的：その他(0/1)
・問4.目的：その他(自由記述)


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HP：https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/mnc_stat.php
メール：mnc_stat☆ml.toho-u.jp
　※「☆」記号を「@」に置き換えて下さい。
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